PubMed
PubMedเป็นเครื่องมือค้นหาฟรีที่เข้าถึงฐานข้อมูลการอ้างอิงและบทคัดย่อของMEDLINE เกี่ยวกับวิทยาศาสตร์ชีวภาพและหัวข้อชีวการแพทย์เป็นหลัก สหรัฐอเมริกาหอสมุดแห่งชาติยา (NLM) ที่สถาบันสุขภาพแห่งชาติรักษาฐานข้อมูลเป็นส่วนหนึ่งของEntrezระบบของการดึงข้อมูล [1]
![]() | |
---|---|
ติดต่อ | |
ศูนย์วิจัย | หอสมุดแห่งชาติการแพทย์ (NLM) ของสหรัฐอเมริกา |
วันที่วางจำหน่าย | มกราคม 2539 |
เข้าไป | |
เว็บไซต์ | pubmed |
จาก 1971-1997, การเข้าถึงออนไลน์ฐานข้อมูล MEDLINE ที่ได้รับส่วนใหญ่ผ่านสิ่งอำนวยความสะดวกสถาบันเช่นห้องสมุดมหาวิทยาลัย [2] PubMed เปิดตัวครั้งแรกในเดือนมกราคม พ.ศ. 2539 เปิดตัวในยุคของการค้นหา MEDLINE แบบส่วนตัวฟรีที่บ้านและที่ทำงาน [3]ระบบ PubMed ให้บริการฟรีแก่ประชาชนโดยเริ่มตั้งแต่เดือนมิถุนายน พ.ศ. 2540 [2]
เนื้อหา
นอกจาก MEDLINE แล้ว PubMed ยังให้การเข้าถึง:
- การอ้างอิงที่เก่ากว่าจากIndex Medicusรุ่นพิมพ์ย้อนกลับไปในปีพ. ศ. 2494 และก่อนหน้านี้
- การอ้างอิงถึงวารสารบางฉบับก่อนที่จะถูกจัดทำดัชนีใน Index Medicus และ MEDLINE เช่นScience , BMJและAnnals of Surgery
- รายการล่าสุดในบันทึกสำหรับบทความก่อนที่จะจัดทำดัชนีด้วยMedical Subject Headings (MeSH) และเพิ่มไปยัง MEDLINE
- คอลเลกชันของหนังสือที่มีข้อความเต็มและชุดย่อยอื่น ๆ ของบันทึก NLM [4]
- การอ้างอิงPMC
- ชั้นวางหนังสือ NCBI
บันทึก PubMed หลายคนมีการเชื่อมโยงไปยังบทความเต็มรูปแบบข้อความบางส่วนที่มีอยู่ได้อย่างอิสระมักจะอยู่ในPubMed กลาง[5]กระจกและท้องถิ่นเช่นยุโรป PubMed กลาง [6]
ข้อมูลเกี่ยวกับวารสารที่จัดทำดัชนีใน MEDLINE และพร้อมใช้งานผ่าน PubMed พบได้ใน NLM Catalog [7]
ณ วันที่ 27 มกราคม 2563[อัปเดต]PubMed มีการอ้างอิงและบทคัดย่อมากกว่า 30 ล้านรายการย้อนหลังไปถึงปีพ. ศ. 2509 โดยได้รับการคัดเลือกถึงปี พ.ศ. 2408 และได้รับการคัดเลือกถึงปี พ.ศ. 2352 ณ วันเดียวกัน[อัปเดต]มีบันทึกของ PubMed 20 ล้านรายการพร้อมบทคัดย่อและ 21.5 ล้านรายการมีลิงก์ไปยังเวอร์ชันข้อความเต็ม (ซึ่งมีบทความ 7.5 ล้านบทความพร้อมข้อความเต็มฟรี) [8]ในช่วง 10 ปีที่ผ่านมา (สิ้นสุดวันที่ 31 ธันวาคม 2019) มีการเพิ่มสถิติใหม่เกือบ 1 ล้านรายการในแต่ละปี ประมาณ 12% ของบันทึกใน PubMed สอดคล้องกับรายการที่เกี่ยวข้องกับมะเร็งซึ่งเพิ่มขึ้นจาก 6% ในปี 1950 เป็น 16% ในปี 2016 [9]สัดส่วนที่สำคัญอื่น ๆ ของบันทึกสอดคล้องกับ "เคมี" (8.69%) "การบำบัด "(8.39%) และ" การติดเชื้อ "(5%) [ ต้องการอ้างอิง ]
ในปี 2016 NLM ได้เปลี่ยนระบบการจัดทำดัชนีเพื่อให้ผู้เผยแพร่สามารถแก้ไขการพิมพ์ผิดและข้อผิดพลาดในบทความที่จัดทำดัชนี PubMed ได้โดยตรง [10]
PubMed ได้รับรายงานว่ามีบางบทความที่ตีพิมพ์ในวารสารที่กินสัตว์อื่น นโยบาย MEDLINE และ PubMed สำหรับการเลือกวารสารสำหรับการรวมฐานข้อมูลแตกต่างกันเล็กน้อย จุดอ่อนในเกณฑ์และขั้นตอนในการจัดทำดัชนีวารสารใน PubMed Central อาจทำให้สิ่งพิมพ์จากวารสารที่กินสัตว์อื่นรั่วไหลไปยัง PubMed ได้ [11]
ลักษณะเฉพาะ
ออกแบบเว็บไซต์
อินเทอร์เฟซ PubMed ใหม่เปิดตัวในเดือนตุลาคม 2552 และสนับสนุนให้ใช้สูตรการค้นหาที่รวดเร็วเหมือน Google พวกเขายังได้รับการอธิบายว่าเป็นการค้นหา "โทรเลข" [12]โดยค่าเริ่มต้นผลลัพธ์จะจัดเรียงตามรายการล่าสุด แต่สามารถเปลี่ยนเป็นการจับคู่ที่ดีที่สุดวันที่ตีพิมพ์ผู้แต่งคนแรกผู้เขียนคนสุดท้ายวารสารหรือชื่อเรื่อง [13]
การออกแบบเว็บไซต์และโดเมน PubMed ได้รับการอัปเดตในเดือนมกราคม 2020 และกลายเป็นค่าเริ่มต้นในวันที่ 15 พฤษภาคม 2020 พร้อมด้วยคุณสมบัติที่อัปเดตและใหม่ [14]มีปฏิกิริยาที่สำคัญจากนักวิจัยหลายคนที่ใช้เว็บไซต์นี้บ่อยครั้ง [15]
PubMed สำหรับอุปกรณ์พกพา / โทรศัพท์มือถือ
PubMed / MEDLINE สามารถเข้าถึงได้ผ่านอุปกรณ์พกพาโดยใช้ตัวอย่างเช่นตัวเลือก"PICO" (สำหรับคำถามทางคลินิกที่มุ่งเน้น) ที่สร้างโดย NLM [16]นอกจากนี้ยังมีตัวเลือก "PubMed Mobile" ซึ่งให้การเข้าถึงเวอร์ชัน PubMed ที่เป็นมิตรกับมือถือและเรียบง่าย [17]
ค้นหา
การค้นหามาตรฐาน
การค้นหาอย่างง่ายบน PubMed สามารถทำได้โดยป้อนประเด็นสำคัญของหัวข้อในหน้าต่างค้นหาของ PubMed
PubMed แปลสูตรการค้นหาเริ่มต้นนี้และเพิ่มชื่อฟิลด์โดยอัตโนมัติคำศัพท์ MeSH (Medical Subject Headings) ที่เกี่ยวข้องคำพ้องความหมายตัวดำเนินการบูลีนและ 'รัง' คำที่เป็นผลลัพธ์อย่างเหมาะสมช่วยเพิ่มการกำหนดรูปแบบการค้นหาอย่างมีนัยสำคัญโดยเฉพาะอย่างยิ่งโดยการรวมกันเป็นประจำ (โดยใช้หรือ ตัวดำเนินการ) textwords และคำศัพท์ MeSH
ตัวอย่างที่ให้ไว้ในบทช่วยสอน PubMed [18]แสดงให้เห็นว่ากระบวนการอัตโนมัติทำงานอย่างไร:
สาเหตุการเดินขณะหลับแปลว่า ("สาเหตุ" [หัวข้อย่อย] หรือ "สาเหตุ" [ทุกฟิลด์] หรือ "สาเหตุ" [ฟิลด์ทั้งหมด] หรือ "เวรกรรม" [ข้อกำหนด MeSH] หรือ "เวรกรรม" [ทุกฟิลด์]) และ ("somnambulism "[ข้อกำหนด MeSH] หรือ" อาการง่วงซึม "[ทุกฟิลด์] หรือ (" นอนหลับ "[ทุกฟิลด์] และ" เดิน "[ฟิลด์ทั้งหมด]) หรือ" การเดินหลับ "[ทุกฟิลด์])
ในทำนองเดียวกัน
soft Attack Aspirin Prevention แปลว่า ("myocardial infarction" [MeSH Terms] หรือ ("myocardial" [All Fields] AND "infarction" [All Fields]) หรือ "myocardial infarction" [All Fields] OR ("heart" [All ฟิลด์] และ "โจมตี" [ฟิลด์ทั้งหมด]) หรือ "หัวใจวาย" [ฟิลด์ทั้งหมด])และ("แอสไพริน" [ข้อกำหนด MeSH] หรือ "แอสไพริน" [ฟิลด์ทั้งหมด])และ("การป้องกันและควบคุม" [หัวข้อย่อย] หรือ ("การป้องกัน" [ฟิลด์ทั้งหมด] และ "การควบคุม" [ฟิลด์ทั้งหมด]) หรือ "การป้องกันและการควบคุม" [ฟิลด์ทั้งหมด] หรือ "การป้องกัน" [ฟิลด์ทั้งหมด])
การค้นหาที่ครอบคลุม
เพื่อการค้นหาที่ดีที่สุดใน PubMed จำเป็นต้องเข้าใจองค์ประกอบหลักคือ MEDLINE และโดยเฉพาะอย่างยิ่งคำศัพท์ที่ควบคุม MeSH (Medical Subject Headings) ที่ใช้ในการจัดทำดัชนีบทความ MEDLINE นอกจากนี้ยังอาจต้องใช้กลยุทธ์การค้นหาที่ซับซ้อนการใช้ชื่อฟิลด์ (แท็ก) การใช้ขีด จำกัด และคุณสมบัติอื่น ๆ อย่างเหมาะสม บรรณารักษ์อ้างอิงและผู้เชี่ยวชาญด้านการค้นหาเสนอบริการค้นหา [19] [20]
แนะนำให้ค้นหาในหน้าต่างค้นหาของ PubMed สำหรับการค้นหาหัวข้อที่ไม่ชัดเจนหรือการแทรกแซงใหม่ ๆ ที่ยังไม่มีการสร้างส่วนหัว MeSH รวมถึงการค้นหาแบรนด์ยาในเชิงพาณิชย์และคำนามที่เหมาะสม นอกจากนี้ยังมีประโยชน์เมื่อไม่มีส่วนหัวที่เหมาะสมหรือตัวอธิบายแสดงถึงลักษณะบางส่วน การค้นหาโดยใช้อรรถาภิธาน MeSH นั้นแม่นยำกว่าและจะให้ผลลัพธ์ที่ไม่เกี่ยวข้องน้อยลง นอกจากนี้ยังช่วยประหยัดข้อเสียของการค้นหาข้อความอิสระซึ่งต้องคำนึงถึงความแตกต่างของการสะกดคำเอกพจน์ / พหูพจน์หรือตัวย่อ ในอีกด้านหนึ่งจะไม่พบบทความที่เพิ่งรวมเข้าในฐานข้อมูลซึ่งยังไม่ได้กำหนดตัวอธิบาย ดังนั้นเพื่อรับประกันการค้นหาอย่างละเอียดถี่ถ้วนจะต้องใช้การผสมผสานระหว่างส่วนหัวของภาษาที่มีการควบคุมและคำที่เป็นข้อความอิสระ [21]
พารามิเตอร์บทความวารสาร
เมื่อจัดทำดัชนีบทความวารสารพารามิเตอร์บทความจำนวนมากจะถูกแยกและจัดเก็บเป็นข้อมูลที่มีโครงสร้าง พารามิเตอร์ดังกล่าว ได้แก่ ประเภทบทความ (คำศัพท์ของ MeSH เช่น "Clinical Trial") ตัวระบุรอง (เงื่อนไข MeSH) ภาษาประเทศของวารสารหรือประวัติการตีพิมพ์ (วันที่เผยแพร่ทางอิเล็กทรอนิกส์วันที่ตีพิมพ์วารสาร)
ประเภทสิ่งพิมพ์: แบบสอบถามทางคลินิก / บทวิจารณ์อย่างเป็นระบบ
พารามิเตอร์ประเภทสิ่งพิมพ์ช่วยให้สามารถค้นหาตามประเภทของสิ่งพิมพ์รวมถึงรายงานการวิจัยทางคลินิกประเภทต่างๆ [22]
รหัสรอง
ตั้งแต่เดือนกรกฎาคม 2548 กระบวนการสร้างดัชนีบทความ MEDLINE จะแยกตัวระบุจากบทคัดย่อของบทความและทำให้ข้อมูลเหล่านั้นอยู่ในฟิลด์ที่เรียกว่าตัวระบุรอง (SI) ฟิลด์ตัวระบุทุติยภูมิคือการจัดเก็บหมายเลขภาคยานุวัติไปยังฐานข้อมูลต่างๆของข้อมูลลำดับโมเลกุลการแสดงออกของยีนหรือสารประกอบทางเคมีและรหัสการทดลองทางคลินิก สำหรับการทดลองทางคลินิก PubMed จะแยกรหัสการทดลองสำหรับการลงทะเบียนการทดลองที่ใหญ่ที่สุดสองรายการ: ClinicalTrials.gov (ตัวระบุ NCT) และทะเบียนหมายเลขทดลองที่ควบคุมโดยสุ่มมาตรฐานสากล (ตัวระบุ IRCTN) [23]
ดูสิ่งนี้ด้วย
ข้อมูลอ้างอิงที่ตัดสินว่าเกี่ยวข้องโดยเฉพาะสามารถทำเครื่องหมายและระบุ "บทความที่เกี่ยวข้อง" ได้ หากเกี่ยวข้องสามารถเลือกการศึกษาหลายชิ้นและสามารถสร้างบทความที่เกี่ยวข้องกับการศึกษาทั้งหมดได้ (บน PubMed หรือฐานข้อมูล NCBI Entrez อื่น ๆ ) โดยใช้ตัวเลือก 'ค้นหาข้อมูลที่เกี่ยวข้อง' จากนั้นบทความที่เกี่ยวข้องจะแสดงตามลำดับ "ความเกี่ยวข้อง" ในการสร้างรายการบทความที่เกี่ยวข้องเหล่านี้ PubMed จะเปรียบเทียบคำจากชื่อเรื่องและบทคัดย่อของการอ้างอิงแต่ละรายการตลอดจนหัวเรื่อง MeSH ที่กำหนดโดยใช้อัลกอริทึมการถ่วงน้ำหนักคำที่มีประสิทธิภาพ [24]ฟังก์ชัน 'บทความที่เกี่ยวข้อง' ได้รับการตัดสินว่ามีความแม่นยำมากจนผู้เขียนบทความแนะนำว่าสามารถใช้แทนการค้นหาแบบเต็มได้ [25]
การแมปกับ MeSH
PubMed จะเชื่อมโยงไปยังข้อกำหนดและหัวเรื่องย่อยของ MeSH โดยอัตโนมัติ ตัวอย่างเช่นลิงก์ "กลิ่นปาก" ไปยัง (และรวมไว้ในการค้นหา) "กลิ่นปาก" "หัวใจวาย" ไปจนถึง "กล้ามเนื้อหัวใจตาย" "มะเร็งเต้านม" ไปจนถึง "เนื้องอกในเต้านม" ตามความเหมาะสมคำศัพท์ MeSH เหล่านี้จะถูก "ขยาย" โดยอัตโนมัตินั่นคือรวมคำศัพท์ที่เฉพาะเจาะจงมากขึ้น คำศัพท์เช่น "การพยาบาล" จะเชื่อมโยงกับ "การพยาบาล [MeSH]" หรือ "การพยาบาล [หัวข้อย่อย]" โดยอัตโนมัติ คุณลักษณะนี้เรียกว่า Auto Term Mapping และมีการบังคับใช้โดยค่าเริ่มต้นในการค้นหาข้อความที่ไม่เสียค่าใช้จ่าย แต่ไม่ใช่การค้นหาแบบวลีที่แน่นอน [26]คุณลักษณะนี้ทำให้การค้นหา PubMed มีความละเอียดอ่อนมากขึ้นและหลีกเลี่ยงการเข้าชมที่ผิดพลาด (พลาด) โดยการชดเชยความหลากหลายของคำศัพท์ทางการแพทย์ [26]
PubMed จะไม่ใช้การแมปคำโดยอัตโนมัติในสถานการณ์ต่อไปนี้: โดยการเขียนวลีที่ยกมา (เช่น "ไต allograft") เมื่อถูกตัดทอนบนเครื่องหมายดอกจัน (เช่นรูปไต allograft *) และเมื่อดูด้วยป้ายชื่อเขตข้อมูล (เช่น มะเร็ง [ติ]). [21]
NCBI ของฉัน
สิ่งอำนวยความสะดวกเสริม PubMed "My NCBI" (พร้อมการลงทะเบียนฟรี) มีเครื่องมือสำหรับ
- บันทึกการค้นหา
- การกรองผลการค้นหา
- การตั้งค่าการอัปเดตอัตโนมัติที่ส่งทางอีเมล
- บันทึกชุดการอ้างอิงที่ดึงมาเป็นส่วนหนึ่งของการค้นหา PubMed
- การกำหนดค่ารูปแบบการแสดงผลหรือการเน้นข้อความค้นหา
และตัวเลือกอื่น ๆ อีกมากมาย [27]พื้นที่ "My NCBI" สามารถเข้าถึงได้จากคอมพิวเตอร์เครื่องใดก็ได้ที่มีการเข้าถึงเว็บ "My NCBI" เวอร์ชันก่อนหน้านี้เรียกว่า "PubMed Cubby" [28]
LinkOut
LinkOut เป็นสิ่งอำนวยความสะดวก NLM ในการเชื่อมโยงและจัดทำสมุดรายวันฉบับเต็มพร้อมใช้งาน [29]ไซต์ 3,200 แห่ง (ส่วนใหญ่เป็นสถาบันการศึกษา) เข้าร่วมในศูนย์ NLM นี้ (ณ เดือนมีนาคม 2010[อัปเดต]) จากมหาวิทยาลัยอัลบอร์กในเดนมาร์กถึงZymoGeneticsในซีแอตเทิล [30]ผู้ใช้ในสถาบันเหล่านี้จะเห็นโลโก้ของสถาบันของตนในผลการค้นหา PubMed (หากจัดเก็บวารสารไว้ที่สถาบันนั้น ๆ ) และสามารถเข้าถึงข้อความฉบับเต็มได้ Link out กำลังรวมเข้ากับ Outside Tool ในการอัปเดตแพลตฟอร์มครั้งใหญ่ที่จะมาถึงในช่วงฤดูร้อนปี 2019 [31]
PubMed Commons
ในปี 2559 PubMed อนุญาตให้ผู้เขียนบทความแสดงความคิดเห็นเกี่ยวกับบทความที่จัดทำดัชนีโดย PubMed คุณลักษณะนี้ได้รับการทดสอบครั้งแรกในโหมดนำร่อง (ตั้งแต่ปี 2556) และได้รับการเผยแพร่อย่างถาวรในปี 2559 [32]ในเดือนกุมภาพันธ์ พ.ศ. 2561 PubMed Commons ได้หยุดให้บริการเนื่องจาก "การใช้งานยังน้อยอยู่" [33] [34]
askMEDLINE
askMEDLINE ซึ่งเป็นเครื่องมือสืบค้นข้อความภาษาธรรมชาติที่เป็นข้อความอิสระสำหรับ MEDLINE / PubMed ซึ่งพัฒนาโดย NLM และเหมาะสำหรับอุปกรณ์พกพา [35]
ตัวระบุ PubMed
PMID (PubMed ระบุหรือ PubMed ระบุไม่ซ้ำกัน) [36]เป็นค่าจำนวนเต็มไม่ซ้ำกันเริ่มต้นที่1
ได้รับมอบหมายให้แต่ละระเบียน PubMed PMID ไม่ได้เช่นเดียวกับPMCID ( P UB M ed C entral ID entifier) ซึ่งเป็นตัวบ่งชี้ในการทำงานทั้งหมดที่ตีพิมพ์ในฟรีเพื่อเข้าถึงPubMed กลาง [37]
การกำหนด PMID หรือ PMCID ให้กับสิ่งพิมพ์จะไม่บอกผู้อ่านเกี่ยวกับประเภทหรือคุณภาพของเนื้อหา PMIDs ได้รับมอบหมายให้จดหมายถึงบรรณาธิการความคิดเห็นบรรณาธิการop-edคอลัมน์และชิ้นส่วนอื่น ๆ ที่ Chooses แก้ไขที่จะรวมในวารสารเช่นเดียวกับเอกสาร peer-reviewed การมีอยู่ของหมายเลขประจำตัวยังไม่สามารถพิสูจน์ได้ว่าเอกสารไม่ได้ถูกเพิกถอนเนื่องจากการฉ้อโกงไร้ความสามารถหรือการประพฤติมิชอบ การประกาศเกี่ยวกับการแก้ไขเอกสารต้นฉบับอาจมีการกำหนด PMID
แต่ละหมายเลขที่ป้อนในหน้าต่างค้นหา PubMed จะถือว่าเป็นค่าเริ่มต้นราวกับว่าเป็น PMID ดังนั้นการอ้างอิงใด ๆ ใน PubMed สามารถค้นหาได้โดยใช้ PMID
อินเทอร์เฟซทางเลือก

หอสมุดแห่งชาติด้านการแพทย์ให้เช่าข้อมูล MEDLINE แก่ผู้ขายส่วนตัวหลายรายเช่นEmbase , Ovid , Dialog , EBSCO , Knowledge Finderและผู้ให้บริการเชิงพาณิชย์ไม่ใช่เชิงพาณิชย์และนักวิชาการอื่น ๆ อีกมากมาย [38]ณ เดือนตุลาคม 2551[อัปเดต]มีการออกใบอนุญาตมากกว่า 500 ใบและมากกว่า 200 ใบให้กับผู้ให้บริการนอกสหรัฐอเมริกา เนื่องจากใบอนุญาตในการใช้ข้อมูล MEDLINE มีให้ใช้งานฟรี NLM จึงมีพื้นที่ทดสอบฟรีสำหรับอินเทอร์เฟซทางเลือก[39] ที่หลากหลายและส่วนเพิ่มเติมของบุคคลที่สามใน PubMed ซึ่งเป็นหนึ่งในฐานข้อมูลขนาดใหญ่เพียงไม่กี่แห่งที่ได้รับการดูแลจัดการอย่างมืออาชีพซึ่งนำเสนอสิ่งนี้ ตัวเลือก
Lu [39]ระบุตัวอย่างเวอร์ชัน PubMed บนเว็บปัจจุบันและเวอร์ชันฟรี 28 เวอร์ชันโดยไม่ต้องติดตั้งหรือลงทะเบียนซึ่งแบ่งออกเป็นสี่ประเภท:
- การจัดอันดับผลการค้นหาเช่นeTBLAST ; MedlineRanker; [40] MiSearch; [41]
- การจัดกลุ่มผลลัพธ์ตามหัวข้อผู้เขียนวารสาร ฯลฯ เช่นAnne O'Tate ; [42] ClusterMed; [43]
- การเพิ่มความหมายและการแสดงภาพตัวอย่างเช่น: EBIMed; [44] MedEvi [45]
- ปรับปรุงอินเทอร์เฟซการค้นหาและประสบการณ์ในการดึงข้อมูลตัวอย่างเช่น askMEDLINE [46] [47] BabelMeSH; [48]และ PubCrawler [49]
เนื่องจากทางเลือกเหล่านี้และทางเลือกอื่น ๆ ส่วนใหญ่อาศัยข้อมูล PubMed / MEDLINE ที่เช่าภายใต้ใบอนุญาตจาก NLM / PubMed จึงแนะนำคำว่า "อนุพันธ์ PubMed" [39]โดยไม่จำเป็นต้องจัดเก็บชุดข้อมูล PubMed ดั้งเดิมประมาณ 90 GB ทุกคนสามารถเขียนแอปพลิเคชัน PubMed โดยใช้อินเทอร์เฟซโปรแกรม eutils-application ดังที่อธิบายไว้ใน "The E-utilities In-Depth: Parameters, Syntax and More" โดย Eric Sayers , ปริญญาเอก. [50]เครื่องกำเนิดรูปแบบการอ้างอิงต่าง ๆ โดยใช้หมายเลข PMID เป็นอินพุตเป็นตัวอย่างของเว็บแอปพลิเคชันที่ใช้อินเทอร์เฟซโปรแกรม eutils-application หน้าเว็บตัวอย่างรวมถึงการอ้างอิงเครื่องปั่นไฟ - มิก Schroeder , Pubmed อ้างอิงปั่นไฟ - อัลตราซาวด์ของสัปดาห์ , PMID2citeและCite นี้สำหรับฉัน
การขุดข้อมูลของ PubMed
วิธีการทางเลือกไปยังเหมืองข้อมูลในการเขียนโปรแกรม PubMed ใช้สภาพแวดล้อมเช่นMatlab , PythonหรือR ในกรณีเหล่านี้การสืบค้นของ PubMed จะถูกเขียนเป็นบรรทัดของโค้ดและส่งต่อไปยัง PubMed จากนั้นการตอบกลับจะถูกประมวลผลโดยตรงในสภาพแวดล้อมการเขียนโปรแกรม สามารถเขียนโค้ดโดยอัตโนมัติเพื่อค้นหาอย่างเป็นระบบด้วยคำหลักที่แตกต่างกันเช่นโรคปีอวัยวะ ฯลฯ สิ่งพิมพ์ล่าสุด (2017) พบว่าสัดส่วนของรายการที่เกี่ยวข้องกับมะเร็งใน PubMed เพิ่มขึ้นจาก 6% ในปี 1950 เป็น 16% ในปี 2016 . [9]
ข้อมูลที่ PubMed สามารถเข้าถึงได้สามารถทำมิเรอร์ได้ในเครื่องโดยใช้เครื่องมือที่ไม่เป็นทางการเช่น MEDOC [51]
ล้านระเบียน PubMed เพิ่มต่าง ๆข้อมูลที่เปิดชุดข้อมูลเกี่ยวกับการเข้าถึงเปิดเช่นUnpaywall เครื่องมือวิเคราะห์ข้อมูลเช่นUnpaywall Journalsถูกใช้โดยไลบรารีเพื่อช่วยในการยกเลิกเรื่องใหญ่ : ไลบรารีสามารถหลีกเลี่ยงการสมัครสมาชิกสำหรับวัสดุที่ให้บริการโดยการเข้าถึงแบบเปิดทันทีผ่านคลังข้อมูลแบบเปิดเช่น PubMed Central [52]
ดูสิ่งนี้ด้วย
- PubMed Central
- ยุโรป PubMed Central
- PubMed Central Canada
- JournalReview.org
- รายชื่อฐานข้อมูลทางวิชาการและเครื่องมือค้นหา
อ้างอิง
- ^ "PubMed"
- ^ ก ข ลินด์เบิร์ก DA (2000) "การเข้าถึงอินเทอร์เน็ตที่ห้องสมุดแห่งชาติของแพทย์" (PDF) ที่มีประสิทธิภาพในการปฏิบัติทางคลินิก 3 (5): 256–60. PMID 11185333 สืบค้นจากต้นฉบับ (PDF)เมื่อ 2 พฤศจิกายน 2556.
- ^ "PubMed ฉลองครบรอบ 10 ปี" แถลงการณ์ทางเทคนิค หอสมุดแห่งชาติสหรัฐอเมริกาแพทยศาสตร์ 5 ตุลาคม 2549 . สืบค้นเมื่อ22 มีนาคม 2554 .
- ^ "PubMed: MEDLINE ดึงบนเวิลด์ไวด์เว็บ" เอกสารข้อเท็จจริง . หอสมุดแห่งชาติแพทยศาสตร์ 7 มิถุนายน 2545 . สืบค้นเมื่อ22 มีนาคม 2554 .
- ^ Roberts RJ (มกราคม 2544) "PubMed กลาง: ใน GenBank ของวรรณกรรมตีพิมพ์" การดำเนินการของสถาบันวิทยาศาสตร์แห่งชาติของสหรัฐอเมริกา 98 (2): 381–2. รหัสไปรษณีย์ : 2001PNAS ... 98..381R . ดอย : 10.1073 / pnas.98.2.381 . PMC 33354 . PMID 11209037
- ^ McEntyre JR, Ananiadou S, Andrews S, Black WJ, Boulderstone R, Buttery P และอื่น ๆ (มกราคม 2554). "UKPMC: ทรัพยากรบทความข้อความเต็มรูปแบบสำหรับวิทยาศาสตร์เพื่อชีวิต" การวิจัยกรดนิวคลีอิก . 39 (ปัญหาฐานข้อมูล): D58-65 ดอย : 10.1093 / nar / gkq1063 . PMC 3013671 PMID 21062818 .
- ^ "แคตตาล็อก NLM: วารสารอ้างอิงใน NCBI ฐาน" NCBI 2554.
- ^ (หมายเหตุ: หากต้องการดูขนาดปัจจุบันของฐานข้อมูลเพียงพิมพ์ "1800: 2100 [dp]" ลงในแถบค้นหาที่ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/แล้วคลิก "ค้นหา")
- ^ ก ข Reyes-Aldasoro CC (2017). "สัดส่วนของรายการเกี่ยวกับมะเร็งใน PubMed เพิ่มขึ้นอย่างมาก" The Emperor of All Maladies "เป็นมะเร็งจริงหรือ? . PLoS ONE 12 (3): e0173671. รหัสไปรษณีย์ : 2017PLoSO..1273671R . ดอย : 10.1371 / journal.pone.0173671 . PMC 5345838 PMID 28282418 .
- ^ "MEDLINE / PubMed ผลิตในระหว่างการปรับปรุง" NLM Technical Bulletin (411): e1. กรกฎาคม - สิงหาคม 2559
- ^ Manca A, Moher D, Cugusi L, Dvir Z, Deriu F (กันยายน 2018) "วารสารที่กินสัตว์อื่นรั่วเข้าสู่ PubMed"ได้อย่างไร CMAJ . 190 (35): E1042 – E1045 ดอย : 10.1503 / cmaj.180154 . PMC 6148641 PMID 30181150
- ^ Clarke J, Wentz R (กันยายน 2543) "แนวทางปฏิบัติที่มีประสิทธิภาพในการดูแลสุขภาพตามหลักฐาน" BMJ . 321 (7260): 566–7. ดอย : 10.1136 / bmj.321.7260.566 / ก . PMC 1118450 . PMID 10968827
- ^ Fatehi F, Grey LC, Wootton R (มกราคม 2014) "วิธีปรับปรุงการค้นหา PubMed / MEDLINE ของคุณ: 2. การตั้งค่าการแสดงคำค้นหาที่ซับซ้อนและการค้นหาหัวข้อ" วารสาร Telemedicine และ Telecare . 20 (1): 44–55. ดอย : 10.1177 / 1357633X13517067 . PMID 24352897 S2CID 43725062
- ^ Trawick, Bart (21 มกราคม 2020). "ปรับปรุงใหม่PubMed®" Musings NLM จากชั้นลอย
- ^ Price, Michael (22 พฤษภาคม 2020). "พวกเขาออกแบบ PubMed เว็บไซต์ที่รัก. มันไม่ได้ไปดีกว่า" วิทยาศาสตร์ .
- ^ "PubMed ผ่านอุปกรณ์พกพา (PICO)" แถลงการณ์ทางเทคนิค หอสมุดแห่งชาติแพทยศาสตร์ พ.ศ. 2547
- ^ "PubMed มือถือเบต้า" แถลงการณ์ทางเทคนิค หอสมุดแห่งชาติแพทยศาสตร์ 2554.
- ^ "เรื่องการค้นหาง่ายด้วยแบบทดสอบ" NCBI พ.ศ. 2553.
- ^ Jadad AR, McQuay HJ (กรกฎาคม 2536) "การค้นหาวรรณกรรม. เป็นระบบในการค้นหาของคุณ" BMJ . 307 (6895): 66. ดอย : 10.1136 / bmj.307.6895.66-a . PMC 1678459 . PMID 8343701
- ^ Allison JJ, Kiefe CI, Weissman NW, Carter J, Centor RM (ฤดูใบไม้ผลิ 1999) "ศิลปะและวิทยาศาสตร์ของการค้นหา MEDLINE ที่จะตอบคำถามทางคลินิก. หาตัวเลขทางขวาของบทความ" International Journal of Technology Assessment in Health Care . 15 (2): 281–96. ดอย : 10.1017 / S0266462399015214 . PMID 10507188
- ^ ก ข กัมโปส - อาเซนซิโอซี (2018). “ Cómo elaborar una estrategia de búsquedabibliográfica”. Enfermería Intensiva (ในภาษาสเปน). 29 (4): 182–186. ดอย : 10.1016 / j.enfi.2018.09.001 . PMID 30291015
- ^ คลินิกแบบสอบถามกรองข้อกำหนดในการอธิบาย NCBI พ.ศ. 2553.
- ^ Huser V, Cimino JJ (มิถุนายน 2013) "การประเมินการยึดมั่นกับคณะกรรมการระหว่างประเทศของนโยบายบรรณาธิการวารสารการแพทย์ของบังคับการลงทะเบียนการทดลองทางคลินิกในเวลาที่เหมาะสม" วารสาร American Medical Informatics Association . 20 (e1): e169-74 ดอย : 10.1136 / amiajnl-2012-001501 . PMC 3715364 . PMID 23396544
- ^ "การคำนวณของบทความที่เกี่ยวข้องอธิบาย" NCBI
- ^ Chang AA, Heskett KM, Davidson TM (กุมภาพันธ์ 2549) "การค้นหาวรรณกรรมโดยใช้หัวเรื่องทางการแพทย์เมื่อเทียบกับข้อความที่มีคำ PubMed" กล่องเสียง 116 (2): 336–40. ดอย : 10.1097 / 01.mlg.0000195371.72887.a2 . PMID 16467730 S2CID 42510351
- ^ ก ข Fatehi F, Grey LC, Wootton R (มีนาคม 2014) "วิธีปรับปรุงการค้นหา PubMed / MEDLINE ของคุณ: 3. การค้นหาขั้นสูง MeSH และ My NCBI" วารสาร Telemedicine และ Telecare . 20 (2): 102–12. ดอย : 10.1177 / 1357633X13519036 . PMID 24614997 S2CID 9948223
- ^ ฉัน NCBI อธิบาย NCBI 13 ธันวาคม 2553.
- ^ "PubMed Cubby" แถลงการณ์ทางเทคนิค หอสมุดแห่งชาติแพทยศาสตร์ พ.ศ. 2543
- ^ "ภาพรวม LinkOut" NCBI พ.ศ. 2553.
- ^ "ผู้เข้าร่วม LinkOut 2011" . NCBI 2554.
- ^ "การปรับปรุง PubMed เป็นในทางของมัน"
- ^ PubMed Commons Team (17 ธันวาคม 2558) "ความเห็นเกี่ยวกับ PubMed: ความสำเร็จของนักบิน"
- ^ "PubMed คอมมอนส์ที่จะยกเลิก" NCBI ข้อมูลเชิงลึก 1 กุมภาพันธ์ 2561 . สืบค้นเมื่อ2 กุมภาพันธ์ 2561 .
- ^ "ปิด PubMed ลงความเห็นของคุณลักษณะ PubMed คอมมอนส์" นาฬิกาถอนกลับ 2 กุมภาพันธ์ 2561 . สืบค้นเมื่อ2 กุมภาพันธ์ 2561 .
- ^ "askMedline" . NCBI 2548.
- ^ "ค้นหาคำอธิบายฟิลด์และแท็ก" แห่งชาติศูนย์ข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ สืบค้นเมื่อ15 กรกฎาคม 2556 .
- ^ Keener M. "PMID กับ PMCID: ต่างกันอย่างไร" (PDF) มหาวิทยาลัยชิคาโก สืบค้นจากต้นฉบับ (PDF)เมื่อ 6 กรกฎาคม 2557 . สืบค้นเมื่อ19 มกราคม 2557 .
- ^ "ลีสซิ่งอ้างอิงวารสารจาก PubMed / เมด" NLM. 2554.
- ^ ก ข ค Lu Z (2011). "PubMed และนอกเหนือจากการสำรวจของเครื่องมือเว็บสำหรับการค้นหาวรรณกรรมชีวการแพทย์" ฐานข้อมูล . 2554 : baq036. ดอย : 10.1093 / database / baq036 . PMC 3025693 . PMID 21245076
- ^ Fontaine JF, Barbosa-Silva A, Schaefer M, Huska MR, Muro EM, Andrade-Navarro MA (กรกฎาคม 2552) "MedlineRanker: มีความยืดหยุ่นการจัดอันดับของวรรณกรรมชีวการแพทย์" การวิจัยกรดนิวคลีอิก . 37 (ปัญหาเว็บเซิร์ฟเวอร์): W141-6. ดอย : 10.1093 / nar / gkp353 . PMC 2703945 PMID 19429696
- ^ States DJ, Ade AS, Wright ZC, Bookvich AV, Athey BD (เมษายน 2552) "การปรับตัว MiSearch PubMed เครื่องมือในการค้นหา" ชีวสารสนเทศศาสตร์ . 25 (7): 974–6. ดอย : 10.1093 / ชีวสารสนเทศศาสตร์ / btn033 . PMC 2660869 PMID 18326507 .
- ^ Smalheiser NR, Zhou W, Torvik VI (กุมภาพันธ์ 2551) "แอนน์ O'Tate: เครื่องมือในการสนับสนุนผู้ใช้ขับเคลื่อนสรุปเจาะลงและการเรียกดูของผลการค้นหา PubMed" วารสารการค้นพบและความร่วมมือทางชีวการแพทย์ . 3 : 2. ดอย : 10.1186 / 1747-5333-3-2 . PMC 2276193 PMID 18279519 .
- ^ "ClusterMed" Vivisimo Clustering Engine 2554. สืบค้นจากต้นฉบับเมื่อ 11 สิงหาคม 2554 . สืบค้นเมื่อ3 กรกฎาคม 2554 .
- ^ Rebholz-Schuhmann D, Kirsch H, Arregui M, Gaudan S, Riethoven M, Stoehr P (มกราคม 2550) "EBIMed - ข้อความกระทืบเพื่อรวบรวมข้อเท็จจริงโปรตีนจากเมด" ชีวสารสนเทศศาสตร์ . 23 (2): e237-44 ดอย : 10.1093 / ชีวสารสนเทศศาสตร์ / btl302 . PMID 17237098
- ^ Kim JJ, Pezik P, Rebholz-Schuhmann D (มิถุนายน 2551) "MedEvi: เรียกหลักฐานต้นฉบับเดิมของความสัมพันธ์ระหว่างแนวคิดชีวการแพทย์จากเมด" ชีวสารสนเทศศาสตร์ . 24 (11): 1410–2. ดอย : 10.1093 / ชีวสารสนเทศศาสตร์ / btn117 . PMC 2387223 PMID 18400773
- ^ Fontelo P, Liu F, Ackerman M, Schardt CM, Keitz SA (2006) "askMEDLINE: รายงานเกี่ยวกับประสบการณ์นานปีเป็น" AMIA ... การดำเนินการประชุมวิชาการประจำปี. AMIA Symposium 2006 : 923. PMC 1839379 PMID 17238542
- ^ Fontelo P, Liu F, Ackerman M (2005) "ตาข่ายสะกด + askMEDLINE: อัตโนมัติเสร็จสมบูรณ์ MeSH แง่แล้วค้นหา MEDLINE / PubMed ผ่านทางข้อความอิสระแบบสอบถามภาษาธรรมชาติ" AMIA ... การดำเนินการประชุมวิชาการประจำปี. AMIA Symposium 2005 : 957. PMC 1513542 PMID 16779244
- ^ Fontelo P, Liu F, Leon S, Anne A, Ackerman M (2007) "PICO นักภาษาศาสตร์และ BabelMeSH: การพัฒนาและการประเมินผลบางส่วนของหลักฐานที่ใช้เครื่องมือค้นหาหลายภาษาสำหรับ MEDLINE / PubMed" การศึกษาเทคโนโลยีสุขภาพและสารสนเทศ . 129 (ปต 1): 817–21. PMID 17911830 .
- ^ Hokamp K, Wolfe KH (กรกฎาคม 2547) "PubCrawler: การรักษาขึ้นกับความสะดวกสบายและ PubMed GenBank" การวิจัยกรดนิวคลีอิก . 32 (ปัญหาเว็บเซิร์ฟเวอร์): W16-9. ดอย : 10.1093 / nar / gkh453 . PMC 441591 PMID 15215341
- ^ Eric Sayers, PhD (24 ตุลาคม 2018). E-สาธารณูปโภคในเชิงลึก: พารามิเตอร์ไวยากรณ์และอื่น ๆ NCBI
- ^ "MEDOC (MEDLINE ดาวน์โหลดประดิษฐ์)" 2560.
- ^ เดนิสวูล์ฟ (7 เมษายน 2020). "SUNY เจรจาต่อรองใหม่, ข้อตกลงการแก้ไขด้วยเอลส์ - ห้องสมุดศูนย์ข่าวมหาวิทยาลัยควายห้องสมุด" library.buffalo.edu . มหาวิทยาลัยบัฟฟาโล. สืบค้นเมื่อ18 เมษายน 2563 .
ลิงก์ภายนอก
- เว็บไซต์อย่างเป็นทางการ
- แท็กการค้นหา PubMed และตัวระบุฟิลด์